Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efcc1Q9JJF6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efcc1Q9JJF6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efcc1Q9JJF6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efcc1Q9JJF6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efcc1Q9JJF6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efcc1Q9JJF6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efcc1Q9JJF6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efcc1Q9JJF6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efcc1Q9JJF6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efcc1Q9JJF6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efcc1Q9JJF6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efcc1Q9JJF6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efcc1Q9JJF6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efcc1Q9JJF6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efcc1Q9JJF6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efcc1Q9JJF6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Efcc1Q9JJF6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efcc1Q9JJF6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efcc1Q9JJF6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Efcc1Q9JJF6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Efcc1Q9JJF6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efcc1Q9JJF6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Efcc1Q9JJF6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Efcc1Q9JJF6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Efcc1Q9JJF6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efcc1Q9JJF6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms