Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA2

Cog8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog8Q9JJA2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog8Q9JJA2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog8Q9JJA2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms