Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad9Q9JIW5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms