Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms