Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClpxQ9JHS4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ClpxQ9JHS4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ClpxQ9JHS4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ClpxQ9JHS4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ClpxQ9JHS4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ClpxQ9JHS4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ClpxQ9JHS4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ClpxQ9JHS4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ClpxQ9JHS4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClpxQ9JHS4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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