Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Tmod3Q9JHJ0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Tmod3Q9JHJ0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Tmod3Q9JHJ0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod3Q9JHJ0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Tmod3Q9JHJ0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod3Q9JHJ0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Tmod3Q9JHJ0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod3Q9JHJ0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod3Q9JHJ0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod3Q9JHJ0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod3Q9JHJ0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod3Q9JHJ0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
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Tmod3Q9JHJ0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod3Q9JHJ0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod3Q9JHJ0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Tmod3Q9JHJ0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Tmod3Q9JHJ0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
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Tmod3Q9JHJ0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Tmod3Q9JHJ0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Tmod3Q9JHJ0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod3Q9JHJ0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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