Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms