Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES30

C1qtnf3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf3Q9ES30 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf3Q9ES30 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf3Q9ES30 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms