Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SelenofQ9ERR7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms