Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms