Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp3a44Q9EQW4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp3a44Q9EQW4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp3a44Q9EQW4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp3a44Q9EQW4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp3a44Q9EQW4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp3a44Q9EQW4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp3a44Q9EQW4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp3a44Q9EQW4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp3a44Q9EQW4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp3a44Q9EQW4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp3a44Q9EQW4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp3a44Q9EQW4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp3a44Q9EQW4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp3a44Q9EQW4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp3a44Q9EQW4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp3a44Q9EQW4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp3a44Q9EQW4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp3a44Q9EQW4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp3a44Q9EQW4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms