Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clca3a2Q9EQR4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a2Q9EQR4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms