Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Vmn1r44Q9EQ47 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Vmn1r44Q9EQ47 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Vmn1r44Q9EQ47 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Vmn1r44Q9EQ47 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Vmn1r44Q9EQ47 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Vmn1r44Q9EQ47 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Vmn1r44Q9EQ47 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Vmn1r44Q9EQ47 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r44Q9EQ47 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vmn1r44Q9EQ47 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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