Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Vmn1r29Q9EQ41 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Vmn1r29Q9EQ41 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Vmn1r29Q9EQ41 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Vmn1r29Q9EQ41 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Vmn1r29Q9EQ41 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Vmn1r29Q9EQ41 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vmn1r29Q9EQ41 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vmn1r29Q9EQ41 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vmn1r29Q9EQ41 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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