Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmg20aQ9DC33 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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