Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csnk1dQ9DC28 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms