Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf1Q9DBU0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms