Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ftsj3Q9DBE9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms