Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB94

Wdr53, WD repeat-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr53Q9DB94 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr53Q9DB94 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms