Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5oQ9DB20 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms