Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9DA42 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9DA42 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9DA42 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9DA42 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9DA42 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9DA42 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9DA42 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9DA42 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9DA42 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9DA42 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9DA42 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9DA42 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9DA42 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9DA42 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9DA42 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9DA42 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9DA42 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9DA42 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9DA42 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9DA42 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9DA42 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9DA42 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9DA42 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9DA42 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9DA42 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9DA42 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9DA42 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9DA42 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9DA42 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9DA42 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9DA42 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9DA42 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9DA42 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9DA42 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms