Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Subh2bvQ9D9Z7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms