Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot8Q9D8X5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms