Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tvp23bQ9D8T4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tvp23bQ9D8T4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms