Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8H7

Oma1, Metalloendopeptidase OMA1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oma1Q9D8H7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms