Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn22Q9D7U6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms