Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms