Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl40Q9D783 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms