Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbe1Q9D6Y9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms