Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MsraQ9D6Y7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MsraQ9D6Y7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms