Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs6Q9D6W8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs6Q9D6W8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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