Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt34Q9D646 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms