Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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Rab11fip1Q9D620 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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Rab11fip1Q9D620 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Rab11fip1Q9D620 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip1Q9D620 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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