Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Ccdc39Q9D5Y1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Ccdc39Q9D5Y1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Ccdc39Q9D5Y1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Ccdc39Q9D5Y1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Ccdc39Q9D5Y1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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