Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D5Q8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms