Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3a3Q9D554 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms