Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms