Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms