Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrameQ9D4Z5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms