Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lonrf3Q9D4H7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms