Protein–RNA interactions for Protein: Q9D498

Iqcf3, IQ domain-containing protein F3, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iqcf3Q9D498 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Iqcf3Q9D498 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms