Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh2Q9D489 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms