Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms