Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms