Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpn3Q9D3W4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpn3Q9D3W4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms