Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph14Q9D3W1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms