Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Trim42Q9D2H5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Trim42Q9D2H5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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