Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhdc8bQ9D2D9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms