Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1R9

Rpl34, 60S ribosomal protein L34, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl34Q9D1R9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl34Q9D1R9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl34Q9D1R9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms