Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms